3号线开通运营后，厦门轨道交通形成“中心放射、三向出岛”的格局，迎来了网络化运营时代。轨道交通换乘站由现在的1个增加到5个，分别是1/2号线换乘站吕厝站、1/3号线湖滨东路站和火炬园站、2/3号线体育中心站和五缘湾站；同时，与轨道交通换乘的BRT站点由2个增加到4个，分别是文灶站、蔡塘站、火车站、双十中学站。因此，3号线开通后，厦门以地铁、BRT为主的快速公共交通网络的覆盖范围将明显扩大，市民群众出行将更加快捷、便利。

　　为确保3号线顺利开通、安全运营，市交通运输局根据《厦门经济特区轨道交通条例》的规定和交通运输部的有关要求，认真组织开展3号线初期运营前安全评估工作，把好3号线开通初期运营前的最后一道关。2021年6月1日至4日，市交通运输局组织交科院检测技术(北京)有限公司对地铁3号线(厦门火车站-蔡厝站段)进行了初期运营前安全评估，安全评估专家组由来自北京、上海、深圳、宁波、西安等城市的20名轨道交通行业专家组成，涵盖了轨道交通土建、车辆、供电、通信、机电、运营等主要专业，专家组对3号线开通载客运营条件进行了全面检验，一致认为厦门地铁3号线(厦门火车站-蔡厝站段)具备开通初期运营的条件。

　　同时，为加强公交与3号线的接驳，方便市民群众出行，市交通运输局组织编制了《轨道交通3号线公交配套衔接方案》，按照“强接驳、增覆盖、减重复、强服务”原则，规划新增或优化公交线路40条，其中3号线开通首日将同步新增开通10条公交线路、优化调整6条公交线路，加强与3号线的接驳，剩余线路将根据3号线开通后客流变化等情况逐步实施；同时，按照公交中途站与地铁出入口原则上不超过100米的目标，新建、迁建了一批公交中途站，实现了所有地铁车站都有公交中途站接驳配套，促进公交与地铁融合发展。此外，为提高地铁与公交换乘便利度，在地铁车站设置了周边公交接驳指引标识，并在运营时间方面加强了公交与地铁的衔接，对与3号线接驳的公交线路运营时间进行了优化调整，为地铁乘客预留5-10分钟进出站换乘时间，确保地铁每个车站首末班至少配套1条公交线路进行接驳。