2001年，尹卫东与北大未名集团合作，带着项目和人马进京，于中关村科技园区内注册成立了北京科兴生物制品有限公司；注册资本1.336亿元

　　2002年7月，甲肝灭活疫苗成功上市，取名“孩尔来福”，使中国的甲肝灭活疫苗全部依赖进口的局面成为历史；

　　2003年，SARS爆发，在市场高度不确定的情况下，尹卫东主动请缨，与中国医学科学院、中国疾病预防控制中心组成研发疫苗的联合课题组；

　　2003与中国医学科学院实验动物研究所、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所共同承担国家“十五”863计划“SARS灭活疫苗的研制”项目以反向收购方式在美国OTCBB挂牌上市，北京科兴成为上市公司Sinovac的控股子公司

　　2004年3月初，北京科兴联合中国疾病预防控制中心正式开始了人用禽流感疫苗的研发；

　　北京科兴的母公司Sinovac转板AMEX挂牌交易，受到全球著名金融银行瑞士信贷顾问有限公司关注，并签约成为公司独家财务顾问

　　2009年，北京科兴成国家唯一指定定点生产甲型H1N1流感疫苗的单位。