据福建省交通运输厅统计，自２００１年“小三通”客运航线正式开通以来，客流量逐年倍增，截至２００９年底累计已近５１０万人次 。今年５月份，闽台海上客运直航运营１５５２航次，运送旅客１５．６５万人次，同比分别增长３７．４６％、１４．９６％。

　　海上货运直航方面，目前福建省沿海福州、松下、宁德、泉州、肖厝、秀屿、漳州、厦门等８个一类港口全部对台开放。自２００８年１２月两岸海上直航启动以来，相关开放港口与台湾高雄、基隆、台中、台北、花莲等港口，开通多条集装箱和散杂货航线。２００９年，福建省海港口岸对台累计完成进出口货运量２２８６．４９万吨，累计完成直航海运集装箱５７．８３万标箱；闽台海上直航累计运送出入境旅客１３８．２８万人次，与去年同比上升３２．０６％。

　　空中直航方面，目前福州、厦门两个航点已开通多条至台北桃园、台北松山、台中、高雄机场的客运航线。２００８年１２月至２００９年底，两个航点共运载旅客２７万余人次。

　　为了加快闽台民航业的交流合作，福建省最近出台的《关于加快民航发展的若干意见》提出，将抓紧完善对台直航基础设施，积极推进闽台民航合作交流，大力开拓闽台直航的中转运输市场，争取到２０１５年形成闽台空中巴士运输。同时，还将扩大闽台直航规模，争取增加闽台直航航班配额，并推动两岸沟通商谈增开、新开闽台空中直航的福州、厦门货运航点和泉州、武夷山客运航点。