据马尾区政府介绍，“两马”航线２００１年１月首航至今，从最初的不定期航班逐步发展到天天有往返航班，缩短了闽台距离，促进了经贸交流。目前，越来越多的马祖乡亲不仅在福州经商，还在福州购置商品房、店面。

    近年来，马尾区先后组织了４０多个团体１０００多人次经“两马”航线，赴马祖进行文化体育交流。连续举办６届的“两马同春闹元宵”规模和影响日益扩大，“两马体育联谊赛”至今已连续举办３届。

    马尾船政天后宫自去年底修复后，丰富了“两马”民俗宗教交流活动。仅今年前８个月，马尾一共接待了４个马祖进香团、近２０００人次。

    “两马”航线还逐渐成为两岸人民的“连心桥”。２００３年７月和２００８年１月，马祖的马港、复兴先后发生火灾，马尾区购置的救灾物资经“两马”航线送到受灾的马祖乡亲手中。“５·１２”汶川地震发生后，马祖许多民众不仅捐出了一日工资，还购置了棉被等救灾物资经“两马”航线转交给灾区人民。