协议内容包括：成立合作协调机构；共同营造合作环境，拓展货源、箱源；推动厦门至各地散杂专列和集装箱班列的开行，拓展海铁联运通道；建立市场营销协作机制；推进南昌、赣州和三明等地“无水港”建设，发挥港口辐射作用；协同推进联运项目口岸通关环境的改善；推进多领域合资合作。

    南昌铁路局就部分协议项目提出具体实施意见，将尽力保证在现有厦门港散货车线基础上每天再增加安排一列车皮４０节的运力。双方同意以现有的合资企业厦门港务鹭榕水铁联运有限公司负责实施共同市场战略，统一对外报价，共同开拓市场。