福州最早的西医活动，出现于清道光十二年（1832年），据史料记载，这年，一位普鲁士的基督教传教士来福州传教，并为人治病。

　　鸦片战争后，福州被辟为五口通商城市之一，前来传教并从事西医活动的传教士逐渐增多。道光二十七年（1847年），美国基督教美以美会（卫理公会）传教士怀特，在南台中洲设立西医诊所，这是福州最早的西医机构。

　　翌年，英国皇家海军与领事馆在中洲合办“海港医馆”，为外籍侨民医病。同治五年（1866年），海港医馆移交西医团体集资兴办，改名福州地方医院。光绪十二年（1886年）地方医院毁于火，次年在塔亭重建，取名“福州塔亭医馆”，这就是现在福州市第二医院的前身。

　　此后至清末民初，外国教会先后于咸丰十年（1860年）在仓山创办圣教妇孺医馆、光绪二十四年（1898年）在北门创办柴井医院、光绪二十六年（1900年）在仓山创办马高爱医院、光绪二十七年（1901年）在马限山创办马限圣教医院、1928年在南门兜创办协和医院。另外，日本人也于1919年在仓山创办博济医院，这家医院后迁址台江达道路改名博爱医院。

　　西医传入福州后，不为民众所接受，人们对高鼻梁、蓝眼睛的“番仔”医生有种出于本能的拒绝，再加上语言不通，“鸡同鸭讲”，病如何看？因此很长一段时间，教会医院门可罗雀。据史志记载，上世纪20年代，各教会医院日门诊量寥寥无几，仓山塔亭医院，日门诊量少则七八人，多则十五六人。虽然建有手术室，但一年做不了几个手术。为吸引病人，医院采用低收费甚至免费的办法，民众还是心有疑惑，深怕有所不测。

　　教会医院“门前冷落车马稀”的状况，直至一批中国西医师学成应聘教会医院或创办私人医院、诊所后，才逐渐改观。由于语言相通，中国西医师与患者的距离拉近了，再加上中国西医师经常走街串巷，到患者家中出诊。一般情况下，西医见效快。在这几种因素的促动下，西医才慢慢为福州民众所接受。

　　1926年，王灼祖在台江苍霞洲创办私立灼祖医院，这是福州最早出现的由中国西医师创办的医院。其后，中国西医师们还创办了一些医院和诊所。这些医院和诊所规模虽然较小，但扩大了西医的影响。因此，福州医史界认为，西医真正传入福州，始于上世纪20年代。

　　1943年，福州鼠疫流行，且来势汹汹。闽侯医师公会的几位核心人物王兆培、陈光桦、王灼祖等人，筹资于达道路博爱医院的废墟上，创办时疫医院，救治鼠疫患者。这是福州最早出现的由中国西医师创办的综合性大医院。数月后，时疫医院改名合组医院。