于2005年12月13日正式开工建设的侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆扩建工程经过近两年时间的建设，如今主体工程已大部完成，目前正在紧张进行后期的相关施工，以确保在今年12月13日——侵华日军南京大屠杀遇难同胞70周年祭之时——新馆如期交付使用。扩建后的新馆全部占地面积为7.32公顷，总建筑面积23064平方米，工程概算总投资达4.78亿元人民币。